Я за - но в школе.
Мальчики и девочки учатся настолько по-разному! Сколько мальчиков страдают из-за того, что менее прилежны, менее аккуратны и им труднее приспособиться к правилам на фоне девочек.
Отличница-девочка в классе - это нормально, их может быть несколько. Отличников-мальчиков всегда меньше (у нас в Озёрном на 3 "круглые" отличницы приходился 1 такой же мальчик-отличник, но и "хорошисты" тоже среди мальчиков реже встречались).
При этом это же не отражает объективного состояния дел! Мальчики вполне могут решать лучше, рисовать лучше, но на фоне прилежных девочек, которые быстрее учатся, как лучше оформить-преподнести, они получают незаслуженные оценки.

В идеале я бы сделала так: разделяла бы учеников на классы смешанно, но на ряд уроков разделяла бы (возможно, на какие-нибудь уроки, где мальчики-девочки более равны, делила бы по другому признаку). Т.е. пусть они учатся в одной школе, пусть у них будут какие-то общие мероприятия, но на математику и т.п. ходили бы в разные классы, возможно, к разным учителям.

Но это утопия, причём весьма непродуманная, конечно :)